Kineserna och andra asiatiska kulturer har använt sig av junkfartyg i årtusenden. Den första kända hänvisningen till fartyg som skrothögar var omkring 2800 f.Kr. under den kinesiske kejsaren Fu Hsi. Junkfartyg hade många användningsområden i den forntida kinesiska kulturen, bland annat fiske, transport, handel, krigföring och utforskning av Sydostasien. Tillsammans med sitt innovativa roderstyrningssystem byggdes djonkerna för att klara av grov sjö, vara lätta att manövrera och förflytta sig snabbt. Den starka konstruktionen av dessa fartyg gjorde det möjligt för kinesiska upptäcktsresande att ta sig långt och brett. Gamla kinesiska mynt har hittats i Indien och till och med vid Afrikas östra kuster! Bevis på junkfartyg finns i muslimernas skrifter om Eufratfloden på 700-talet, och Marco Polo skrev om flottor av junkfartyg på 1200-talet. När Marco Polo skrev om dessa fartyg var de flesta ganska stora, med 50-60 hytter ombord. På 1400-talet hade djonkerna dock blivit kolossala i storlek! Dessa massiva, välbyggda fartyg sades vara 400 fot långa och 160 fot breda (det är 40 våningar från fören till aktern och 16 våningar från styrbord till babord)!
En av de unika egenskaperna hos junkerna var formen på deras segel, som skiljde sig mycket från de västerländska fartygens. Kinesiska djonker var inte fyrkantiga utan hade elliptiska, böjda segel som förstärktes med inre stänger av bambu. Eftersom bambuen höll seglen starka behövdes mindre rigg. Det hindrade också själva seglen från att fräsa och ruttna så snabbt som de annars skulle ha gjort.
Den uppfinningsrikedom och styrka som dessa fartyg hade har gjort att de kan fortsätta att användas i dag. Vissa juntor används för turism, men det finns fortfarande juntor som används för fiske och handel i Kinas, Japans och Indonesiens kustvatten och floder. Även om den typiska junk har krympt i storlek från 400 fot till cirka 70 fot är de fortfarande tillräckligt stora för att vissa familjer ska kunna bo i dem.