W 2012 roku Germanotta i jej córka, Lady Gaga, współzałożyły fundację Born This Way Foundation, organizację non-profit skupiającą się na inspirowaniu młodzieży, zakończeniu zastraszania i budowaniu społeczności. W tym samym roku fundacja otrzymała nagrodę za wybitne osiągnięcia od Family Online Safety Institute. Pod kierownictwem Germanotty fundacja otrzymała również nagrodę National Association of School Psychologists’ Special Friend to Children Award w 2013 roku oraz nagrodę Anti-Defamation League’s No Place for Hate Making a Difference Award w 2015 roku. Germanotta została uhonorowana przez Boston PFLAG oraz przez Dancing Classrooms za jej działania na rzecz zdrowia psychicznego młodzieży.
Germanotta jest rzeczniczką Women’s Council on Heart Health dla Ronald O. Perelman Heart Institute i zasiada w zarządzie Empowerment Initiative na University of Nebraska-Lincoln. Była również członkiem Ladies Auxiliary Committee of The Columbus Citizens Foundation, za co w 2015 roku otrzymała Humanitarian Award. Od 2016 roku służy jako członek Rady Gubernatorów Parsons School of Design.
W dniu 10 czerwca 2018 roku Germanotta zwróciła się do Zgromadzenia Ogólnego Organizacji Narodów Zjednoczonych w imieniu Fundacji Born This Way i uruchomiła inicjatywę United for Global Mental Health. 20 maja 2019 roku Światowa Organizacja Zdrowia Narodów Zjednoczonych ogłosiła, że Germanotta będzie jednym z czterech nowych Ambasadorów Dobrej Woli, jako ambasador zdrowia psychicznego.
.