V roce 2012 Germanotta spolu se svou dcerou Lady Gaga založila neziskovou organizaci Born This Way Foundation, která se zaměřuje na inspiraci mládeže, ukončení šikany a budování komunit. Později téhož roku byla nadaci udělena cena Family Online Safety Institute za mimořádné úspěchy. Pod Germanottovým vedením získala nadace v roce 2013 také cenu Národní asociace školních psychologů „Zvláštní přítel dětí“ a v roce 2015 cenu Ligy proti hanobení „No Place for Hate Making a Difference Award“. Germanottová byla oceněna bostonskou organizací PFLAG a organizací Dancing Classrooms za svou obhajobu týkající se duševního zdraví mládeže.
Germanottová je obhájkyní Ženské rady pro zdraví srdce při Kardiologickém institutu Ronalda O. Perelmana a působí ve správní radě Iniciativy pro posílení postavení na Univerzitě Nebraska-Lincoln. Působila také ve výboru Ladies Auxiliary Foundation of The Columbus Citizens, za což v roce 2015 obdržela Humanitární cenu. Od roku 2016 působí jako členka správní rady Parsons School of Design.
Dne 10. června 2018 vystoupila Germanottová na Valném shromáždění OSN jménem nadace Born This Way a zahájila iniciativu United for Global Mental Health. Dne 20. května 2019 oznámila Světová zdravotnická organizace OSN, že Germanotta bude jedním ze čtyř nových velvyslanců dobré vůle, a to jako velvyslanec pro duševní zdraví.