În 2012, Germanotta și fiica ei, Lady Gaga, au co-fondat Fundația Born This Way, o organizație non-profit axată pe inspirația tinerilor, pe eliminarea bullying-ului și pe consolidarea comunităților. Ulterior, în același an, fundația a primit premiul Family Online Safety Institute pentru realizări deosebite. Sub conducerea lui Germanotta, fundația a primit, de asemenea, Premiul Special Friend to Children al Asociației Naționale a Psihologilor Școlari în 2013 și Premiul No Place for Hate Making a Difference al Anti-Defamation League în 2015. Germanotta a fost onorată de Boston PFLAG și de Dancing Classrooms pentru susținerea sa în ceea ce privește sănătatea mintală a tinerilor.
Germanotta este un susținător al Women’s Council on Heart Health pentru Ronald O. Perelman Heart Institute și face parte din consiliul de administrație al Empowerment Initiative de la University of Nebraska-Lincoln. De asemenea, a făcut parte din Comitetul doamnelor auxiliare al Fundației Columbus Citizens, pentru care a primit Premiul umanitar în 2015. Începând din 2016, ea este membră a Consiliului Guvernatorilor pentru Parsons School of Design.
La 10 iunie 2018, Germanotta s-a adresat Adunării Generale a Organizației Națiunilor Unite în numele Fundației Born This Way și a lansat inițiativa United for Global Mental Health. La 20 mai 2019, Organizația Mondială a Sănătății a Națiunilor Unite a anunțat că Germanotta va fi unul dintre cei patru noi ambasadori ai bunăvoinței, în calitate de ambasador pentru sănătatea mintală.
.