Nadal tog hem sin första Wimbledon-titel och blev den tredje mannen i den öppna eran att vinna både French Open och Wimbledon samma år. Han blev också den andra spanjoren att vinna den brittiska tennisturneringen. Det avslutade också Federers rekordsträcka på fem Wimbledonsegrar i rad.
Senare samma år vann han sin andra Rogers Cup-titel och vann US Open Series, vilket gjorde honom till tennisvärldens nummer ett för första gången. Detta avslutade Federers fyra och ett halvt års styre på toppen. Nadal fortsatte sedan med att vinna guld vid de olympiska spelen i Peking och blev den första manliga spelaren som rankades bland de fem främsta att göra det.
Under årets sista månader var Nadal dock tvungen att avbryta flera matcher på grund av en knäskada. Sedan dess har han emellanåt hindrats av skador men har ändå förblivit en av de bästa tennisspelarna i världen.
Han har vunnit 15 titlar sedan 2008 och 2009 vann Nadal Australian Open och försvarade sin Wimbledon-titel. Han fortsatte även med att vinna sin första US Open och sin femte franska Grand Slam 2010.
Året därpå förlorade han sin världsranking som nummer ett samt Wimbledon till den serbiske tennisspelaren Novak Djokovic. Nadal återhämtade sig från nederlaget i juni i år och slog Djokovic för att vinna sin rekordstora sjunde Franska öppna titel, vilket aldrig tidigare har lyckats.
I Wimbledon 2012 förlorade Nadal mot den tjeckiske spelaren Lukas Rosol i Wimbledons andra omgång, vilket vissa kommentatorer har betecknat som en av de största överraskningarna i tennishistorien. Nadal är bara den andra manliga tennisspelaren som fullbordar Career Golden Slam, vilket innebär att vinna French, Australian och US Opens, Wimbledon och OS-guldmedaljen. Han är för närvarande rankad som nummer ett i världen, tack vare en imponerande comeback 2013.
När det gäller hans privatliv har han varit tillsammans med Maria Francisca Perello, en anställd på ett försäkringsbolag, sedan 2005. Han släppte även sin självbiografi Rafa i augusti 2011.