Livscykel
Under parningstiden slåss hanarna ofta med varandra. Hanen och honan utför också en slags parnings ”dans”. Hanen jagar honan. Så småningom stannar honan och vänder sig mot hanen och boxar mot honom med framtassarna. Vid någon tidpunkt hoppar en av dem rakt upp i luften och sedan hoppar den andra också upp i luften. 
Den östra kottontailen parar sig mellan februari och september. Honan bygger ett bo i en fördjupning i marken och fodrar det med mjuka material och päls från bröstet. Honan föder ungefär en månad efter parningen. Hon får mellan en och nio ungar, även om hon vanligtvis får fyra till fem ungar. Honan matar ungarna två gånger om dagen. Ungarna avvänjs efter cirka tre veckor och lämnar boet efter cirka sju veckor. Honan kan para sig igen bara några timmar efter att ha fött. Honorna kan få tre eller fyra kullar per år. Östliga bomullstussar är redo att para sig när de är tre månader gamla.
Beteende
Den östra bomullstrollsländan är solitär och mycket territoriell. Den är mestadels nattaktiv, men den kommer ibland ut tidigt på morgonen och i skymningen och ibland under dagen på mörka dagar. Den östra bomullstussen kan hoppa avstånd på mellan 10 och 15 fot. Den ställer sig ibland på bakbenen för att hålla utkik efter rovdjur som prärievargar, rävar, vesslor, örnar och hökar. När ett rovdjur jagar den hoppar den ofta från sida till sida för att bryta sitt doftspår. Den kan springa i hastigheter på upp till 15 miles i timmen.