Pepperidge Farm a été fondée en 1939 par Margaret Rudkin, une maman de trois garçons. Elle a commencé à faire du pain de blé entier dans la cuisine de sa ferme de Fairfield, dans le Connecticut, pour son fils, Mark, qui souffrait d’allergies et de maladies et ne pouvait pas manger la plupart des pains commerciaux disponibles à l’époque.
Les médecins ont recommandé son pain sain aux patients qui avaient besoin d’un régime plus nutritif et bientôt Margaret a commencé à vendre des miches dans son épicerie locale. La qualité était si bonne que le pain était vendu 25 cents, alors que tous les autres pains ne coûtaient que 10 cents.
La nouvelle de l’excellent pain de Margaret se répandit et elle passa finalement de la cuisson du pain sur sa ferme à une grande boulangerie en 1947. Dans les années qui ont suivi, Margaret a fait de la marque Pepperidge Farm une entreprise alimentaire nationale, s’étendant au-delà du pain aux biscuits, crackers, gâteaux et pâtisseries.
Les crackers Goldfish ont été lancés aux États-Unis en 1962 après que Margaret ait visité une entreprise suisse de biscuits haut de gamme, Kambly, et ait essayé leurs crackers Goldfish. Margaret a vu le potentiel et a conclu un accord avec Kambly SA pour fabriquer et vendre le produit aux États-Unis. Les premiers parfums disponibles étaient Fromage, Pizza, Smoky BBQ et Légèrement salé (maintenant appelé Original).