Tidigt i The Matrix får Neo reda på att hans liv, så som han känner till det, har varit en illusion, en datorgenererad värld som är bortom allt som till och med hans egen datorhackerkänsla kan förstå. Han kommer snabbt över sin chock och tar sig an uppgiften att befria andra från det virtuella öde som har påtvingats dem. Neos väg till upplysning är snabb och smidig. Han söks av dem som redan förstår sanningen och ges valet att lära sig sanningen eller återvända till ett liv i falskhet. Han väljer den röda pillen – det val som öppnar hans ögon och ändrar hans inriktning från lat hackare till universums hjälte. Neo visar aldrig mycket känslor, och vi får en känsla av hans växande självförtroende främst genom att se hans alltmer chockerande och skickliga kamprörelser.
I takt med att han omfamnar sin roll blir Neo en Kristusfigur i trilogin. Morpheus, Oraklet och andra karaktärer i Matrixtrilogin kallar Neo för ”den ende”, och de är säkra på att han är mannen som kommer att befria och rädda dem. Det finns flera paralleller mellan Neo och Kristus. Neo återuppstår från de döda i slutet av The Matrix, vilket befäster hans roll som människosläktets frälsare. Kristus var både jordisk och gudomlig, och Neo kan, när han väl har förstått vem han är, se matrisens kod som täcker allt omkring honom, vilket visar hans egen förmåga att överskrida uppdelningen mellan världar. Till och med Neos namn i Matrix, Thomas Anderson, antyder en parallell till Kristus. ”Anderson” betyder bokstavligen ”människoson”, en fras som används för att beskriva Kristus i evangelierna. ”Thomas” antyder den nytestamentliga figuren av lärjungen Thomas som inte tror på Kristi uppståndelse förrän han ser bevis med sina egna ögon. Neo gör samma koppling mellan att tro och se, och han tvivlar på sig själv och sina förmågor tills han börjar samla erfarenheter. Det är inte meningen att Neo faktiskt ska representera Kristus, men dessa antydda kopplingar höjer hans status i filmerna och understryker den viktiga roll han spelar i kampen för att rädda mänskligheten.