Em 1920, o Jones Act exigiu que as embarcações com bandeira dos EUA fossem construídas nos Estados Unidos, de propriedade de cidadãos americanos e documentadas sob as leis dos Estados Unidos. Todas as mercadorias que entravam ou saíam do Alasca tinham de ser transportadas por transportadoras americanas e enviadas para Seattle antes do embarque, tornando o Alasca dependente do estado de Washington. A Suprema Corte dos Estados Unidos decidiu que a disposição da Constituição que diz que um estado não deve se impor sobre o comércio de outro não se aplicava porque o Alasca era apenas um território. Os preços cobrados pelas empresas de transporte marítimo de Seattle começaram a subir para aproveitar a situação.
A Grande Depressão fez com que os preços do peixe e do cobre, que eram vitais para a economia do Alasca na época, caíssem. Os salários baixaram e a força de trabalho diminuiu em mais da metade. Em 1935, o presidente Franklin D. Roosevelt pensou que os americanos das áreas agrícolas poderiam ser transferidos para o Vale Matanuska-Susitna do Alasca para uma nova oportunidade de auto-sustentação agrícola. Os colonos eram em grande parte de estados do norte, como Michigan, Wisconsin e Minnesota, sob a crença de que somente aqueles que cresceram com climas semelhantes aos do Alasca poderiam lidar com a vida dos colonos de lá. A United Congo Improvement Association pediu ao presidente para estabelecer 400 agricultores afro-americanos no Alasca, dizendo que o território ofereceria plenos direitos políticos, mas o preconceito racial e a crença de que somente aqueles dos estados do norte fariam colonos adequados causaram o fracasso da proposta.
A exploração e o estabelecimento do Alasca não teria sido possível sem o desenvolvimento de aeronaves, o que permitiu o influxo de colonos para o interior do estado e o rápido transporte de pessoas e suprimentos por todo o país. No entanto, devido às condições climáticas desfavoráveis do estado e à alta proporção de pilotos em relação à população, mais de 1.700 naufrágios de aeronaves estão espalhados por todo o seu domínio. Numerosos naufrágios também traçam suas origens para a construção militar do estado durante a Segunda Guerra Mundial e a Guerra Fria.
A importância estratégica do Alaska para os Estados Unidos tornou-se mais evidente durante a Segunda Guerra Mundial. Em abril de 1942, mais de 200 pessoas de origem japonesa no território foram retiradas à força e enviadas para campos de internação no interior, como resultado da Ordem Executiva 9066, que autorizou o governo a despejar e internar qualquer pessoa de ascendência japonesa da costa do Pacífico. De junho de 1942 até agosto de 1943 os japoneses invadiram os EUA por meio da cadeia das Ilhas Aleutianas, na Batalha das Ilhas Aleutianas. Isto marcou a primeira vez desde a Guerra de 1812 que o solo americano foi ocupado por um inimigo estrangeiro. Os japoneses foram eventualmente repelidos das Ilhas Aleutas por uma força de 34.000 soldados americanos.
Na Primavera e Verão de 1945, a Baía Fria na Península do Alasca foi o local do maior e mais ambicioso programa de transferência da Segunda Guerra Mundial, o Projecto Hula, no qual os Estados Unidos transferiram 149 navios e embarcações para a União Soviética e treinaram 12.000 militares soviéticos na sua operação em antecipação à entrada da União Soviética na guerra contra o Japão. A qualquer momento, cerca de 1.500 funcionários americanos estavam em Cold Bay e Fort Randall durante o Projeto Hula.