Matrixin alkupuolella Neo oppii, että hänen elämänsä sellaisena kuin hän sen tuntee, on ollut illuusio, tietokoneella luotu maailma, joka ylittää kaiken sen, mitä edes hänen oma tietokonehakkerin herkkyytensä kykenee ymmärtämään. Hän toipuu järkytyksestään nopeasti ja ryhtyy vapauttamaan muita virtuaalisesta kohtalosta, joka heille on langetettu. Neon tie valaistumiseen on nopea ja sujuva. Ne, jotka jo ymmärtävät totuuden, etsivät häntä ja antavat hänelle mahdollisuuden valita, oppiiko hän totuuden vai palaako hän valheelliseen elämään. Hän valitsee punaisen pillerin – valinnan, joka avaa hänen silmänsä ja muuttaa hänet laiskasta hakkerista universumin sankariksi. Neo ei koskaan osoita paljon tunteita, ja saamme käsityksen hänen kasvavasta itseluottamuksestaan lähinnä seuraamalla hänen yhä järkyttävämpiä ja taitavampia taisteluliikkeitään.
Kun hän omaksuu roolinsa, Neosta tulee trilogian Kristus-hahmo. Morfeus, Oraakkeli ja muut Matrixtrilogian hahmot kutsuvat Neoa ”The One”, ja he ovat varmoja, että hän on mies, joka vapauttaa ja pelastaa heidät. Neon ja Kristuksen välillä on useita rinnastuksia. Neo herätetään kuolleista Matrixin lopussa, mikä vahvistaa hänen asemaansa ihmisrodun pelastajana. Kristus oli sekä maallinen että jumalallinen, ja kun Neo on täysin ymmärtänyt, kuka hän on, hän näkee Matrixin koodin peittävän kaiken ympärillään, mikä osoittaa hänen oman kykynsä ylittää maailmojen välinen ero. Jopa Neon Matrix-nimi, Thomas Anderson, viittaa rinnastukseen Kristuksen kanssa. ”Anderson tarkoittaa kirjaimellisesti ”ihmisen poikaa”, jota käytetään kuvaamaan Kristusta evankeliumeissa. ”Thomas” viittaa Uuden testamentin opetuslapsi Tuomaan hahmoon, joka ei usko Kristuksen ylösnousemukseen ennen kuin näkee todisteet omilla silmillään. Neo tekee saman yhteyden uskomisen ja näkemisen välille, ja hän epäilee itseään ja kykyjään, kunnes hän alkaa todella kerryttää kokemusta. Neon ei ole tarkoitus itse asiassa edustaa Kristusta, mutta nämä ehdotetut yhteydet nostavat hänen asemaansa elokuvissa ja korostavat hänen tärkeää rooliaan taistelussa ihmiskunnan pelastamiseksi.