ArticleAtoms to Phenotypes: Molecular Design Principles of Cellular Energy Metabolism

Raportoimme 100 miljoonan atomin laajuisen mallin kokonaisesta soluelimestä, purppurabakteerin fotosynteettisestä kromatofoorivesikkelistä, joka paljastaa energiamuunnosvaiheiden kaskadin, joka huipentuu ATP:n tuottamiseen auringonvalosta. Vesikkelin molekyylidynamiikkasimulaatioissa selvitetään, miten integraaliset kalvokompleksit vaikuttavat paikalliseen kaarevuuteen pigmenttien valoherkistyksen säätämiseksi. Pienten molekyylien Brownin dynamiikka kromatofoorin sisällä tutkii varauksen suunnatun kuljetuksen mekanismeja eri pH- ja suolapitoisuusolosuhteissa. Fenotyyppisten ominaisuuksien toistaminen atomistisista yksityiskohdista käsin osoittaa kineettisen mallin avulla, että bakteerin matalan valon sopeutuminen on spontaani tulos kromatofoorin rakenteellisen eheyden ja vankan energiamuunnoksen välisen tasapainon optimoinnista. Mallissa vedetään yhtäläisyyksiä yleisempään mitokondrioiden bioenergiakoneistoon, josta johdetaan molekyylitason näkemyksiä solujen ikääntymisen mekanismista. Yhdessä integroiva menetelmämme ja spektroskooppiset kokeet tasoittavat tietä kokonaisten elävien solujen ensimmäisen periaatteen mallintamiseen.

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista.