Guvernul filipinez se desfășoară într-un cadru organizat de republică prezidențială, reprezentativă și democratică, în care președintele este atât șeful statului, cât și șeful guvernului. Acest sistem se învârte în jurul a trei ramuri separate și suverane, dar interdependente: ramura legislativă (organul legislativ), ramura executivă (organul de aplicare a legii) și ramura judiciară (organul de interpretare a legii). Puterea executivă este exercitată de guvern sub conducerea președintelui. Puterea legislativă este exercitată atât de guvern, cât și de Congresul bicameral – Senatul (camera superioară) și Camera Reprezentanților (camera inferioară). Puterea judecătorească este conferită instanțelor, Curtea Supremă din Filipine fiind cel mai înalt organism judiciar.
Puterea executivă
Puterea executivă este condusă de președinte, care funcționează atât ca șef de stat, cât și ca șef de guvern. Președintele este, de asemenea, comandantul-șef al Forțelor Armate ale Filipinelor. Președintele este ales prin vot popular pentru un mandat de șase ani. Apoi, președintele numește (și îi poate demite) pe membrii cabinetului său pe care îl conduce. Sediul executiv al guvernului este administrat oficial de la Palatul Malacañang – care este, de asemenea, reședința oficială a președintelui – din Manila. Președintele nu mai poate candida pentru realegere, cu excepția cazului în care devine președinte prin succesiune constituțională și nu a servit mai mult de patru ani ca președinte.
Cel de-al doilea oficial cel mai înalt, vicepreședintele este primul în linia de succesiune în cazul în care președintele demisionează, este pus sub acuzare sau moare în funcție. De obicei, deși nu întotdeauna, vicepreședintele poate fi un membru al cabinetului președintelui. În cazul în care se vacantează postul de vicepreședinte, președintele va numi orice membru al Congresului (de obicei, un membru de partid) ca nou vicepreședinte. Numirea va fi validată prin votul a trei pătrimi din Congresul care votează separat.
Biroul legislativ
Celelalte locuri din Cameră sunt destinate reprezentanților sectoriali aleși la scară largă prin intermediul unui sistem complex de „liste de partid”, care se bazează pe faptul că partidul primește cel puțin 2% până la 6% din totalul voturilor la nivel național. Camera superioară se află în Pasay City, în timp ce Camera inferioară se află în Quezon City. Reprezentanții districtuali și sectoriali sunt aleși cu un mandat de trei ani. Aceștia pot fi realeși, dar nu mai au dreptul de a candida pentru un al patrulea mandat consecutiv. Senatorii sunt aleși cu un mandat de șase ani. Aceștia pot fi realeși, dar nu mai au dreptul să candideze pentru un al treilea mandat consecutiv. Camera Reprezentanților poate opta pentru adoptarea unei rezoluții în cazul vacantării unui loc în legislativ, care va deschide calea pentru organizarea unor alegeri speciale. Câștigătorul alegerilor speciale va îndeplini mandatul nefinalizat al reprezentantului districtual anterior; acest lucru va fi considerat ca fiind un singur mandat electiv. Aceeași regulă se aplică și în Senat, însă se aplică numai în cazul în care locul este vacant înainte de alegerile legislative obișnuite.
Regula judiciară
Regula judiciară a guvernului este condusă de Curtea Supremă, care are în fruntea sa un președinte și 14 judecători asociați, toți numiți de președinte la recomandarea Consiliului Judiciar și al Baroului. Alte tipuri de instanțe judecătorești, cu jurisdicție variabilă în jurul arhipelagului, sunt::
Curți colegiale inferioare
- Curtea de apel
- Curtea de apel fiscal
- Sandiganbayan
Curți ordinare
- Curți regionale de judecată
- Curtea metropolitană de judecată Instanțe judecătorești
- Instanțe judecătorești municipale
- Instanțe judecătorești municipale în orașe
- Instanțe judecătorești municipale de circumscripție
Instanțe musulmane
- Instanțe judecătorești districtuale
- Instanțe judecătorești de circumscripție
.