Identification of Staphylococcus saprophyticus isolated from patients with urinary tract infection using a simple set of biochemical tests correlating with 16S-23S interspace region molecular weight patterns

Występowanie Staphylococcus spp. nie tylko jako patogenów człowieka, ale także jako rezerwuarów determinant antybiotykooporności, wymaga opracowania metod ich szybkiej i wiarygodnej identyfikacji w próbkach o znaczeniu medycznym. Celem pracy było porównanie trzech fenotypowych metod identyfikacji Staphylococcus spp. izolowanych od pacjentów z zakażeniem układu moczowego z wykorzystaniem PCR regionu międzyprzestrzennego 16S-23S generującego wzorce masy cząsteczkowej (ITR-PCR) jako metody referencyjnej. Wszystkie 57 badanych S. saprophyticus zostało prawidłowo zidentyfikowanych przy użyciu wyłącznie krążka z nowobiocyną. Uzyskano zgodność 98,0% dla uproszczonej baterii testów biochemicznych w odniesieniu do ITR-PCR, podczas gdy system Vitek I i krążek z nowobiocyną wykazały zgodność odpowiednio 81,2% i 89,1%. Nie zidentyfikowano żadnego innego szczepu non-S. saprophyticus opornego na nowobiocynę. Tak więc dysk z nowobiocyną jest realną alternatywą dla identyfikacji S. saprophyticus w próbkach moczu w laboratoriach o ograniczonych zasobach. ITR-PCR i uproszczona bateria testów biochemicznych były bardziej wiarygodne niż obecnie dostępne systemy komercyjne. Badanie to potwierdza, że zautomatyzowane systemy nadal nie są w stanie prawidłowo różnicować gatunków CoNS i że proste, niezawodne i niedrogie metody mogą być stosowane do rutynowej identyfikacji.