Nadal holte sich seinen ersten Wimbledon-Titel und wurde der dritte Mann in der Open-Ära, der sowohl die French Open als auch Wimbledon im selben Jahr gewann. Er war außerdem der zweite Spanier, der das britische Tennisturnier gewinnen konnte. Damit endete auch Federers Rekord von fünf Wimbledon-Siegen in Folge.
Später im selben Jahr gewann er seinen zweiten Rogers Cup-Titel und die US Open Series, wodurch er zum ersten Mal die Nummer eins der Tenniswelt wurde. Dies beendete Federers viereinhalbjährige Herrschaft an der Spitze. Anschließend gewann Nadal bei den Olympischen Spielen in Peking Gold und war damit der erste männliche Spieler, der unter den ersten fünf platziert war.
In den letzten Monaten des Jahres musste Nadal jedoch wegen einer Knieverletzung mehrere Spiele aufgeben. Seitdem wird er immer wieder von Verletzungen geplagt, ist aber nach wie vor einer der besten Tennisspieler der Welt.
Seit 2008 hat er 15 Titel gewonnen, 2009 gewann Nadal die Australian Open und verteidigte seinen Wimbledon-Titel. Außerdem gewann er 2010 seine ersten US Open und sein fünftes Grand-Slam-Turnier in Frankreich.
Im folgenden Jahr verlor er seine Weltrangliste und Wimbledon an den serbischen Tennisspieler Novak Djokovic. Im Juni dieses Jahres erholte sich Nadal von seiner Niederlage und schlug Djokovic, um seinen siebten French-Open-Titel zu gewinnen, was ihm zuvor noch nie gelungen war.
Beim Wimbledon-Turnier 2012 verlor Nadal in der zweiten Runde gegen den tschechischen Spieler Lukas Rosol, was einige Kommentatoren als eine der größten Überraschungen der Tennisgeschichte bezeichneten. Nadal ist erst der zweite männliche Tennisspieler, der den Golden Slam der Karriere geschafft hat, d. h. den Gewinn der French, Australian und US Open, von Wimbledon und der Goldmedaille bei den Olympischen Spielen. Dank eines beeindruckenden Comebacks im Jahr 2013 ist er derzeit die Nummer eins der Weltrangliste.
Im Privatleben ist er seit 2005 mit Maria Francisca Perello, einer Versicherungsangestellten, zusammen. Außerdem veröffentlichte er im August 2011 seine Autobiografie Rafa.