Die philippinische Regierung ist in einer präsidialen, repräsentativen und demokratischen Republik organisiert, in der der Präsident sowohl das Staatsoberhaupt als auch der Regierungschef ist. Dieses System besteht aus drei separaten und souveränen, aber dennoch voneinander abhängigen Zweigen: der Legislative (der gesetzgebenden Körperschaft), der Exekutive (der gesetzausübenden Körperschaft) und der Judikative (der gesetzauslegenden Körperschaft). Die Exekutivgewalt wird von der Regierung unter der Leitung des Präsidenten ausgeübt. Die Legislativgewalt liegt bei der Regierung und dem aus zwei Kammern bestehenden Kongress – dem Senat (Oberhaus) und dem Repräsentantenhaus (Unterhaus). Die richterliche Gewalt liegt bei den Gerichten, wobei der Oberste Gerichtshof der Philippinen die höchste richterliche Instanz darstellt.
Exekutive
Die Exekutive wird vom Präsidenten geleitet, der sowohl als Staatsoberhaupt als auch als Regierungschef fungiert. Der Präsident ist auch Oberbefehlshaber der Streitkräfte der Philippinen. Der Präsident wird vom Volk für eine Amtszeit von sechs Jahren gewählt. Der Präsident ernennt (und kann entlassen) seine Kabinettsmitglieder, denen er vorsteht. Der Regierungssitz der Exekutive wird offiziell vom Malacañang-Palast in Manila aus verwaltet, der auch die offizielle Residenz des Präsidenten ist. Der Präsident kann nicht mehr zur Wiederwahl antreten, es sei denn, er wird durch die verfassungsmäßige Nachfolge zum Präsidenten und hat nicht länger als vier Jahre als Präsident gedient.
Der Vizepräsident ist der zweithöchste Beamte und steht in der Nachfolge an erster Stelle, wenn der Präsident zurücktritt, angeklagt wird oder im Amt stirbt. Der Vizepräsident kann in der Regel, wenn auch nicht immer, Mitglied des Kabinetts des Präsidenten sein. Ist das Amt des Vizepräsidenten vakant, ernennt der Präsident ein beliebiges Mitglied des Kongresses (in der Regel ein Parteimitglied) zum neuen Vizepräsidenten. Die Ernennung wird durch eine Dreiviertelmehrheit des Kongresses bestätigt, der getrennt abstimmt.
Legislative Abteilung
Die restlichen Sitze des Repräsentantenhauses sind für sektorale Vertreter bestimmt, die über ein komplexes „Parteilisten“-System gewählt werden, das davon abhängt, dass die Partei mindestens 2 bis 6 % der nationalen Stimmen erhält. Das Oberhaus befindet sich in Pasay City, während das Unterhaus in Quezon City liegt. Die Bezirks- und Sektorvertreter werden für eine Amtszeit von drei Jahren gewählt. Sie können wiedergewählt werden, dürfen aber nicht mehr für eine vierte aufeinanderfolgende Amtszeit kandidieren. Die Senatoren werden für eine Amtszeit von sechs Jahren gewählt. Sie können wiedergewählt werden, dürfen aber nicht mehr für eine dritte aufeinanderfolgende Amtszeit kandidieren. Das Repräsentantenhaus kann eine Resolution für einen frei werdenden Sitz in der Legislative verabschieden, die den Weg für eine Sonderwahl ebnet. Der Gewinner der Sonderwahl tritt in die unvollendete Amtszeit des vorherigen Bezirksvertreters ein; dies wird als eine Wahlperiode gewertet. Die gleiche Regel gilt für den Senat, allerdings nur, wenn der Sitz vor den regulären Parlamentswahlen frei wird.
Justiz
Die Judikative der Regierung wird vom Obersten Gerichtshof geleitet, der einen Obersten Richter als Vorsitzenden und 14 beigeordnete Richter hat, die alle vom Präsidenten auf Empfehlung des Justiz- und Anwaltsrats ernannt werden. Andere Gerichtstypen mit unterschiedlichen Zuständigkeiten auf dem Archipel sind die:
Niedere Kollegialgerichte
- Berufungsgericht
- Steuerberufungsgericht
- Sandiganbayan
Reguläre Gerichte
- Regionale Prozessgerichte
- Metropolitane Prozessgerichte Gerichte
- Gemeindegerichte
- Gemeindegerichte in Städten
- Gemeindebezirksgerichte
Muslimische Gerichte
- Sharia Bezirksgerichte
- Sharia Bezirksgerichte