Filipínská vláda se odehrává v organizovaném rámci prezidentské, zastupitelské a demokratické republiky, v níž je prezident zároveň hlavou státu i hlavou vlády. Tento systém se točí kolem tří oddělených a svrchovaných, avšak na sobě závislých složek: zákonodárné moci (orgán vydávající zákony), výkonné moci (orgán prosazující zákony) a soudní moci (orgán vykládající zákony). Výkonnou moc vykonává vláda pod vedením prezidenta. Zákonodárnou moc má vláda i dvoukomorový Kongres – Senát (horní komora) a Sněmovna reprezentantů (dolní komora). Soudní moc náleží soudům, přičemž nejvyšším soudním orgánem je Nejvyšší soud Filipín.
Větev výkonná
Ve výkonné moci stojí v čele prezident, který funguje jako hlava státu i hlava vlády. Prezident je rovněž vrchním velitelem ozbrojených sil Filipín. Prezident je volen v lidovém hlasování na dobu šesti let. Prezident pak jmenuje (a může odvolat) členy svého kabinetu, kterému předsedá. Výkonné sídlo vlády je oficiálně spravováno z paláce Malacañang – který je zároveň oficiálním sídlem prezidenta – v Manile. Prezident se již nemůže ucházet o znovuzvolení, ledaže by se stal prezidentem na základě ústavního nástupnictví a vykonával funkci prezidenta nejvýše čtyři roky.
Druhý nejvyšší úředník, viceprezident, je první v pořadí nástupnictví v případě, že prezident odstoupí, je zbaven funkce nebo zemře ve funkci. Viceprezident obvykle, i když ne vždy, může být členem prezidentova kabinetu. Pokud se uvolní místo viceprezidenta, jmenuje prezident novým viceprezidentem kteréhokoli člena Kongresu (obvykle člena strany). Jmenování bude potvrzeno třemi čtvrtinami hlasů Kongresu hlasujících odděleně.
Zákonodárná moc
Zbytek křesel ve Sněmovně reprezentantů je určen pro zástupce jednotlivých sektorů, kteří jsou voleni volně prostřednictvím složitého systému „stranických seznamů“, který závisí na tom, zda strana získá alespoň 2 až 6 % celostátního počtu hlasů. Horní sněmovna sídlí v Pasay City, zatímco dolní sněmovna se nachází v Quezon City. Okresní a sektoroví zástupci jsou voleni na tři roky. Mohou být zvoleni znovu, ale již nemohou kandidovat na čtvrté po sobě jdoucí období. Senátoři jsou voleni na šest let. Mohou být zvoleni znovu, ale již nemohou kandidovat na třetí po sobě jdoucí období. Sněmovna reprezentantů se může rozhodnout přijmout usnesení o uvolnění místa zákonodárce, které otevře cestu k mimořádným volbám. Vítěz mimořádných voleb bude vykonávat nedokončené funkční období předchozího zástupce obvodu; to se bude považovat za jedno volební období. Stejné pravidlo platí i v Senátu, avšak pouze v případě, že se mandát uvolní před řádnými volbami do zákonodárného sboru.
Soudní moc
V čele soudní moci stojí Nejvyšší soud, v jehož čele stojí předseda soudu a 14 pomocných soudců, kteří jsou jmenováni prezidentem na základě doporučení soudcovské a advokátní rady. Dalšími typy soudů s různou příslušností po celém souostroví jsou např:
nižší kolegiální soudy
- odvolací soud
- odvolací daňový soud
- sandiganbayan
řádné soudy
- regionální soudy
- metropolitní soudy Soudy
- Městské soudy
- Městské soudy ve městech
- Městské obvodní soudy
Muslimské soudy
- Obvodní soudy šária
- Obvodní soudy šária