Al principio de Matrix, Neo se da cuenta de que su vida, tal y como la conoce, ha sido una ilusión, un mundo generado por ordenador más allá de lo que puede comprender incluso su propia sensibilidad de hacker informático. Se sobrepone rápidamente a su shock y emprende la tarea de liberar a los demás del destino virtual que se les ha impuesto. El camino de Neo hacia la iluminación es rápido y sin complicaciones. Es buscado por aquellos que ya comprenden la verdad y se le da la opción de aprender la verdad o volver a una vida de falsedad. Elige la píldora roja, la elección que le abre los ojos y le hace cambiar de perezoso hacker a héroe del universo. Neo nunca muestra demasiadas emociones, y nos hacemos una idea de su creciente confianza en sí mismo sobre todo al ver sus movimientos de lucha, cada vez más impactantes y hábiles.
Al aceptar su papel, Neo se convierte en una figura de Cristo en la trilogía. Morfeo, el Oráculo y otros personajes de la trilogía Matrix llaman a Neo «el Elegido», y están seguros de que es el hombre que los liberará y salvará. Existen varios paralelismos entre Neo y Cristo. Neo resucita de entre los muertos al final de Matrix, una hazaña que consolida su papel como salvador de la raza humana. Cristo era a la vez terrenal y divino, y Neo, una vez que comprende plenamente quién es, puede ver el código de Matrix cubriendo todo lo que le rodea, lo que demuestra su propia capacidad de trascender la división entre reinos. Incluso el nombre de Neo en Matrix, Thomas Anderson, sugiere un paralelismo con Cristo. «Anderson» significa literalmente «hijo del hombre», una frase utilizada para describir a Cristo en los Evangelios. «Thomas» sugiere la figura del discípulo Tomás en el Nuevo Testamento, que no cree en la resurrección de Cristo hasta que no ve la prueba con sus propios ojos. Neo hace esta misma conexión entre creer y ver, y duda de sí mismo y de sus capacidades hasta que empieza a acumular experiencia. No se pretende que Neo represente realmente a Cristo, pero estas conexiones sugeridas elevan su estatus en las películas y subrayan el importante papel que desempeña en la batalla por salvar a la raza humana.