Früh in der Matrix erfährt Neo, dass sein Leben, so wie er es kannte, eine Illusion war, eine computergenerierte Welt, die nicht einmal seine eigene Computer-Hacker-Sensibilität begreifen kann. Er überwindet seinen Schock schnell und macht sich an die Aufgabe, andere von dem virtuellen Schicksal zu befreien, das ihnen aufgezwungen wurde. Neos Weg zur Erleuchtung ist schnell und reibungslos. Er wird von denen aufgesucht, die die Wahrheit bereits kennen, und vor die Wahl gestellt, die Wahrheit zu lernen oder in ein Leben der Falschheit zurückzukehren. Er entscheidet sich für die rote Pille – eine Entscheidung, die ihm die Augen öffnet und ihn vom faulen Hacker zum Helden des Universums werden lässt. Neo zeigt nie viele Emotionen, und wir bekommen ein Gefühl für sein wachsendes Selbstvertrauen, indem wir seine zunehmend schockierenden und geschickten Kampfbewegungen beobachten.
Indem er seine Rolle annimmt, wird Neo zu einer Christusfigur in der Trilogie. Morpheus, das Orakel und andere Figuren in der Matrixtrilogie nennen Neo „den Einen“, und sie sind sich sicher, dass er der Mann ist, der sie befreien und retten wird. Es gibt mehrere Parallelen zwischen Neo und Christus. Neo wird am Ende von The Matrix von den Toten auferweckt, eine Leistung, die seine Rolle als Retter der Menschheit festigt. Christus war sowohl irdisch als auch göttlich, und Neo kann, nachdem er verstanden hat, wer er ist, den Code der Matrix sehen, der alles um ihn herum bedeckt, was seine eigene Fähigkeit, die Trennung zwischen den Welten zu überwinden, demonstriert. Selbst Neos Name in der Matrix, Thomas Anderson, deutet auf eine Parallele zu Christus hin. „Anderson“ bedeutet wörtlich „Menschensohn“, ein Ausdruck, der in den Evangelien zur Beschreibung Christi verwendet wird. „Thomas“ deutet auf die neutestamentliche Figur des Jüngers Thomas hin, der erst dann an die Auferstehung Christi glaubt, wenn er den Beweis mit seinen eigenen Augen sieht. Neo stellt dieselbe Verbindung zwischen Glauben und Sehen her, und er zweifelt an sich und seinen Fähigkeiten, bis er beginnt, tatsächlich Erfahrungen zu sammeln. Neo soll nicht wirklich Christus repräsentieren, aber diese angedeuteten Verbindungen erhöhen seinen Status in den Filmen und unterstreichen die wichtige Rolle, die er im Kampf zur Rettung der menschlichen Rasse spielt.