Frigt i The Matrix finder Neo ud af, at hans liv, som han kender det, har været en illusion, en computergenereret verden, der overgår alt, hvad selv hans egen computer-hacker-sensitivitet kan forstå. Han kommer hurtigt over sit chok og påtager sig opgaven at befri andre fra den virtuelle skæbne, der er blevet påtvunget dem. Neos vej til oplysning er hurtig og gnidningsløs. Han bliver opsøgt af dem, der allerede forstår sandheden, og får valget mellem at lære sandheden eller vende tilbage til et liv i falskhed. Han vælger den røde pille – det valg, der åbner hans øjne og ændrer hans retning fra doven hacker til universets helt. Neo viser aldrig mange følelser, og vi får en fornemmelse af hans voksende selvtillid primært ved at se hans stadig mere chokerende og dygtige kampskridt.
I takt med at han tager sin rolle til sig, bliver Neo en Kristusfigur i trilogien. Morpheus, Oraklet og andre personer i Matrixtrilogien kalder Neo for “den eneste ene”, og de er sikre på, at han er den mand, der vil befri og redde dem. Der er flere paralleller mellem Neo og Kristus. Neo genopstår fra de døde i slutningen af Matrix, en bedrift, der cementerer hans rolle som menneskehedens frelser. Kristus var både jordisk og guddommelig, og Neo kan, når han fuldt ud forstår, hvem han er, se Matrix’ kode, der dækker alt omkring ham, hvilket viser hans egen evne til at overskride adskillelsen mellem rigerne. Selv Neos navn i Matrix, Thomas Anderson, antyder en parallel til Kristus. “Anderson” betyder bogstaveligt talt “menneskesøn”, et udtryk, der bruges til at beskrive Kristus i evangelierne. “Thomas” antyder den nytestamentlige figur af disciplen Thomas, som ikke vil tro på Kristi opstandelse, før han ser beviset med sine egne øjne. Neo gør den samme forbindelse mellem at tro og se, og han tvivler på sig selv og sine evner, indtil han rent faktisk begynder at samle erfaringer. Det er ikke meningen, at Neo faktisk skal repræsentere Kristus, men disse antydede forbindelser hæver hans status i filmene og understreger den vigtige rolle, han spiller i kampen for at redde menneskeheden.